l 酶切分析及各種酶切圖譜打印分析(如模擬膠等) |
l 序列特征分析(堿基組成分析、GC%分析、在CsCl中的沉降分析、Tm值分析等) |
l 各種引物設計分析(如多重PCR引物設計、甲基化PCR引物設計、標簽表達PCR引物設計等等)、 |
l 序列的同源比較及同源檢索相關分析 |
l RNA二級結構預測分析 |
l 重復序列(同向、反向、鏡像重復,反向互補的重復分析等)、完全相同的重復、相似程度的重復(如75%同源的重復分析等) |
l ORF分析 |
l 雙核苷酸對數量分析(如G-C, A-T,A-G等等) |
l GC% plot、Tm plot分析 |
l 原核序列的啟動子預測分析 |
l 真核序列的啟動子預測分析 |
l 增強子序列的預測、尋找與分析 |
l 序列翻譯(ORF)縱覽分析(overview);按不同物種的密碼進行翻譯分析 |
l CpG島的預測分析、基因剪接位點(splice site)預測分析、polyA signal (加尾信號)預測與分析等 |
l 質粒畫圖:根據genbank文件作出各種非常漂亮的質粒圖譜 |
l 細菌人工染色體(BAC)分析與提取、基因敲除或突變小鼠的策略分析 |
l ssDNA和dsDNA的OD值與相應摩爾數的計算; 分子量計算 |
l siRNA預測 |